Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkpd1Q0VF94 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkpd1Q0VF94 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkpd1Q0VF94 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms