Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt80Q0VBK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt80Q0VBK2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt80Q0VBK2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt80Q0VBK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms