Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc45a4Q0P5V9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc45a4Q0P5V9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc45a4Q0P5V9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms