Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgm3Q08189 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgm3Q08189 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tgm3Q08189 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm3Q08189 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm3Q08189 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm3Q08189 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms