Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou6f1Q07916 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou6f1Q07916 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou6f1Q07916 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou6f1Q07916 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pou6f1Q07916 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms