Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Siah1bQ06985 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25,87■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Siah1bQ06985 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Siah1bQ06985 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Siah1bQ06985 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Siah1bQ06985 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,2 ms