Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc2Q05020 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc2Q05020 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoc2Q05020 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc2Q05020 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms