Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sox12Q04890 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sox12Q04890 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sox12Q04890 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Sox12Q04890 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sox12Q04890 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms