Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nf1Q04690 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nf1Q04690 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nf1Q04690 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nf1Q04690 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms