Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RelaQ04207 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RelaQ04207 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RelaQ04207 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RelaQ04207 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RelaQ04207 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RelaQ04207 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RelaQ04207 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RelaQ04207 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RelaQ04207 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RelaQ04207 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RelaQ04207 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelaQ04207 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RelaQ04207 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RelaQ04207 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms