Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tff2Q03404 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tff2Q03404 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tff2Q03404 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tff2Q03404 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tff2Q03404 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms