Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msx2Q03358 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Msx2Q03358 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Msx2Q03358 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Msx2Q03358 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms