Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mc1rQ01727 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mc1rQ01727 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mc1rQ01727 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mc1rQ01727 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms