Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp1Q01514 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp1Q01514 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp1Q01514 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp1Q01514 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms