Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gja5Q01231 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gja5Q01231 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja5Q01231 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gja5Q01231 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja5Q01231 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja5Q01231 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms