Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin2cQ01098 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grin2cQ01098 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grin2cQ01098 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2cQ01098 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2cQ01098 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms