Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Grin2bQ01097 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Grin2bQ01097 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Grin2bQ01097 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Grin2bQ01097 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Grin2bQ01097 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Grin2bQ01097 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Grin2bQ01097 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Grin2bQ01097 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms