Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Il6stQ00560 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Il6stQ00560 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Il6stQ00560 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Il6stQ00560 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Il6stQ00560 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms