Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms