Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp9bP98195 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp9bP98195 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp9bP98195 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp9bP98195 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp9bP98195 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms