Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfdP97946 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfdP97946 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfdP97946 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfdP97946 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfdP97946 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfdP97946 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VegfdP97946 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfdP97946 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfdP97946 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfdP97946 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms