Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad5P97454 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad5P97454 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad5P97454 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad5P97454 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smad5P97454 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad5P97454 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad5P97454 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smad5P97454 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad5P97454 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad5P97454 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad5P97454 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad5P97454 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad5P97454 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad5P97454 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad5P97454 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad5P97454 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad5P97454 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad5P97454 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad5P97454 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad5P97454 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad5P97454 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smad5P97454 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad5P97454 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad5P97454 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad5P97454 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad5P97454 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad5P97454 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad5P97454 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad5P97454 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad5P97454 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad5P97454 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.1 ms