Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smyd1P97443 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd1P97443 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smyd1P97443 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd1P97443 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd1P97443 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1849.8 ms