Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Psme1P97371 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Psme1P97371 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Psme1P97371 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Psme1P97371 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Psme1P97371 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Psme1P97371 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Psme1P97371 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Psme1P97371 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Psme1P97371 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Psme1P97371 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Psme1P97371 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Psme1P97371 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Psme1P97371 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Psme1P97371 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Psme1P97371 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Psme1P97371 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Psme1P97371 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Psme1P97371 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Psme1P97371 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Psme1P97371 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Psme1P97371 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Psme1P97371 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Psme1P97371 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Psme1P97371 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Psme1P97371 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Psme1P97371 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Psme1P97371 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms