Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct3P80318 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct3P80318 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct3P80318 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct3P80318 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct3P80318 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cct3P80318 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct3P80318 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct3P80318 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct3P80318 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct3P80318 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cct3P80318 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct3P80318 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct3P80318 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct3P80318 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct3P80318 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cct3P80318 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct3P80318 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct3P80318 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct3P80318 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct3P80318 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct3P80318 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct3P80318 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct3P80318 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct3P80318 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cct3P80318 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cct3P80318 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cct3P80318 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct3P80318 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cct3P80318 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct3P80318 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cct3P80318 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms