Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sparcl1P70663 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sparcl1P70663 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sparcl1P70663 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 424.1 ms