Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ldb1P70662 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ldb1P70662 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ldb1P70662 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ldb1P70662 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms