Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rit1P70426 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rit1P70426 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rit1P70426 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rit1P70426 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rit1P70426 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rit1P70426 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rit1P70426 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rit1P70426 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rit1P70426 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rit1P70426 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rit1P70426 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rit1P70426 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms