Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad50P70388 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad50P70388 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad50P70388 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad50P70388 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad50P70388 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad50P70388 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rad50P70388 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rad50P70388 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rad50P70388 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rad50P70388 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rad50P70388 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rad50P70388 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rad50P70388 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms