Protein–RNA interactions for Protein: P70353

Nfyc, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfycP70353 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfycP70353 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfycP70353 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfycP70353 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfycP70353 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfycP70353 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfycP70353 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfycP70353 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfycP70353 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfycP70353 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfycP70353 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NfycP70353 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NfycP70353 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfycP70353 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfycP70353 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfycP70353 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfycP70353 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfycP70353 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfycP70353 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NfycP70353 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NfycP70353 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfycP70353 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfycP70353 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfycP70353 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfycP70353 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfycP70353 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfycP70353 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfycP70353 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfycP70353 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfycP70353 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfycP70353 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfycP70353 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfycP70353 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfycP70353 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfycP70353 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfycP70353 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfycP70353 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfycP70353 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfycP70353 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfycP70353 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfycP70353 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfycP70353 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfycP70353 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfycP70353 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfycP70353 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NfycP70353 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfycP70353 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfycP70353 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfycP70353 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfycP70353 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfycP70353 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NfycP70353 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NfycP70353 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfycP70353 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NfycP70353 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NfycP70353 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfycP70353 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfycP70353 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NfycP70353 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfycP70353 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfycP70353 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfycP70353 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfycP70353 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfycP70353 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfycP70353 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfycP70353 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfycP70353 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfycP70353 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfycP70353 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfycP70353 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfycP70353 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfycP70353 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfycP70353 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfycP70353 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfycP70353 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfycP70353 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfycP70353 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfycP70353 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfycP70353 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfycP70353 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfycP70353 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfycP70353 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfycP70353 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfycP70353 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfycP70353 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfycP70353 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfycP70353 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfycP70353 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfycP70353 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfycP70353 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfycP70353 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfycP70353 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms