Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp3P70281 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp3P70281 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sycp3P70281 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sycp3P70281 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms