Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtgdrP70263 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtgdrP70263 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtgdrP70263 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtgdrP70263 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtgdrP70263 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtgdrP70263 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtgdrP70263 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtgdrP70263 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtgdrP70263 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgdrP70263 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms