Protein–RNA interactions for Protein: P70213

Fv1, Friend virus susceptibility protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv1P70213 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fv1P70213 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv1P70213 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Fv1P70213 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fv1P70213 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fv1P70213 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fv1P70213 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fv1P70213 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fv1P70213 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fv1P70213 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fv1P70213 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fv1P70213 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms