Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Traf5P70191 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Traf5P70191 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Traf5P70191 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Traf5P70191 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf5P70191 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Traf5P70191 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Traf5P70191 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf5P70191 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf5P70191 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Traf5P70191 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Traf5P70191 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Traf5P70191 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf5P70191 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms