Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps17P63276 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps17P63276 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps17P63276 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps17P63276 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps17P63276 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps17P63276 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps17P63276 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rps17P63276 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps17P63276 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps17P63276 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps17P63276 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps17P63276 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms