Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabrb3P63080 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrb3P63080 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabrb3P63080 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrb3P63080 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms