Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnb1P62874 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gnb1P62874 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gnb1P62874 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gnb1P62874 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gnb1P62874 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gnb1P62874 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms