Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou3f4P62515 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou3f4P62515 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pou3f4P62515 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pou3f4P62515 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms