Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd3P62320 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpd3P62320 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd3P62320 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd3P62320 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms