Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpeP62305 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SnrpeP62305 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms