Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem258P61166 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem258P61166 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tmem258P61166 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem258P61166 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem258P61166 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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