Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgf1P61148 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgf1P61148 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgf1P61148 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fgf1P61148 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgf1P61148 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgf1P61148 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgf1P61148 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgf1P61148 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgf1P61148 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgf1P61148 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf1P61148 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf1P61148 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgf1P61148 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms