Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab8bP61028 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab8bP61028 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab8bP61028 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab8bP61028 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab8bP61028 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab8bP61028 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8bP61028 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8bP61028 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8bP61028 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8bP61028 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8bP61028 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8bP61028 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8bP61028 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8bP61028 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8bP61028 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rab8bP61028 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8bP61028 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8bP61028 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab8bP61028 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab8bP61028 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab8bP61028 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab8bP61028 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab8bP61028 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab8bP61028 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab8bP61028 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab8bP61028 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab8bP61028 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms