Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfia3P60469 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfia3P60469 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfia3P60469 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfia3P60469 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppfia3P60469 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfia3P60469 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms