Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdrg1P59048 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdrg1P59048 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdrg1P59048 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdrg1P59048 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms