Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn4P57780 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Actn4P57780 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn4P57780 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn4P57780 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn4P57780 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actn4P57780 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn4P57780 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn4P57780 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn4P57780 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn4P57780 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn4P57780 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms