Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtnsP57757 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtnsP57757 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtnsP57757 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtnsP57757 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtnsP57757 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtnsP57757 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtnsP57757 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms