Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lim2P56563 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lim2P56563 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lim2P56563 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lim2P56563 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lim2P56563 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lim2P56563 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lim2P56563 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lim2P56563 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lim2P56563 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lim2P56563 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lim2P56563 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lim2P56563 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lim2P56563 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lim2P56563 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lim2P56563 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lim2P56563 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lim2P56563 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lim2P56563 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lim2P56563 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lim2P56563 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms