Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5g3P56384 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5g3P56384 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g3P56384 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g3P56384 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g3P56384 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g3P56384 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5g3P56384 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.3 ms