Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab8aP55258 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab8aP55258 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab8aP55258 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab8aP55258 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rab8aP55258 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab8aP55258 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab8aP55258 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab8aP55258 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8aP55258 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8aP55258 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8aP55258 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab8aP55258 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab8aP55258 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab8aP55258 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab8aP55258 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab8aP55258 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab8aP55258 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab8aP55258 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rab8aP55258 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rab8aP55258 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab8aP55258 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab8aP55258 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab8aP55258 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab8aP55258 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab8aP55258 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab8aP55258 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab8aP55258 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab8aP55258 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms