Protein–RNA interactions for Protein: P54818

Galc, Galactocerebrosidase, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalcP54818 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GalcP54818 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GalcP54818 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GalcP54818 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GalcP54818 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GalcP54818 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GalcP54818 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GalcP54818 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GalcP54818 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GalcP54818 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GalcP54818 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GalcP54818 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GalcP54818 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GalcP54818 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GalcP54818 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GalcP54818 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GalcP54818 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GalcP54818 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GalcP54818 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GalcP54818 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GalcP54818 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GalcP54818 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GalcP54818 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GalcP54818 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GalcP54818 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GalcP54818 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GalcP54818 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GalcP54818 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GalcP54818 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GalcP54818 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GalcP54818 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GalcP54818 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GalcP54818 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GalcP54818 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GalcP54818 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GalcP54818 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GalcP54818 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GalcP54818 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GalcP54818 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GalcP54818 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GalcP54818 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GalcP54818 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GalcP54818 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GalcP54818 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GalcP54818 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GalcP54818 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GalcP54818 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GalcP54818 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GalcP54818 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GalcP54818 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GalcP54818 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GalcP54818 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GalcP54818 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GalcP54818 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GalcP54818 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GalcP54818 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GalcP54818 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GalcP54818 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GalcP54818 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GalcP54818 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GalcP54818 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GalcP54818 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GalcP54818 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GalcP54818 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GalcP54818 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GalcP54818 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GalcP54818 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GalcP54818 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GalcP54818 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GalcP54818 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GalcP54818 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GalcP54818 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GalcP54818 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GalcP54818 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GalcP54818 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GalcP54818 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GalcP54818 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GalcP54818 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GalcP54818 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GalcP54818 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GalcP54818 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GalcP54818 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GalcP54818 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GalcP54818 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GalcP54818 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GalcP54818 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GalcP54818 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GalcP54818 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GalcP54818 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GalcP54818 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GalcP54818 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GalcP54818 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GalcP54818 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GalcP54818 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GalcP54818 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GalcP54818 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GalcP54818 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GalcP54818 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GalcP54818 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GalcP54818 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms